关键词:
产品推荐

细胞生物学

酶免试剂盒

细胞因子(重组蛋白)

生化试剂

实验用抗体

分子生物学

蛋白研究

实验室仪器

实验室耗材

技术服务

联系我们

上海研卉生物科技有限公司

地址:上海市嘉定区叶城路1288号

电话:021-69000211

联系人:李先生

手机:18702156455

传真:021-69000211

MSN:yanhuibio@hotmail.com

QQ:1320534253,245676794

邮箱:yanhuibio@163.com

您现在的位置:首页 > 产品中心 > GeneRead DNA FFPE Kit (50)

GeneRead DNA FFPE Kit (50)

货  号:180134

产品规格:50

原  产  地:德国

参考价格:3360 (参考价格,以实际价格为准)

优惠价格:

产品详细信息

GeneRead DNA FFPE Kit (50)

180134

从FFPE组织样本中高效纯化基因组DNA,适合用于NGS分析

  • 采用优化的裂解液,可从FFPE样品中高效回收gDNA
  • 酶促反应去除胞嘧啶脱氨产物
  • 最大限度减少假阳性SNP检出风险
  • 在DNA测序应用中获得出色结果
  • 可在QIAcube全自动核酸纯化仪上自动运行
GeneRead DNA FFPE Kit采用基于硅胶模离心柱的优化实验方案,能够从福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织样本中纯化出高品质基因组DNA。由于胞嘧啶的脱氨作用所导致 的C>T人为突变现象在二代测序技术中影响很大。此类人为突变由福尔马林固定以及样本老化所引发,会导致测序结果产生偏差。GeneRead FFPE纯化步骤中引入了酶促处理,能够消除此类人为突变,从而保证了基因组DNA的产量高、纯度好,特别适用于二代测序应用。
原理
从FFPE组织为二代测序制备DNA还有几个挑战。由于样品稀缺和DNA可能存在受损状况,DNA产量通常较为有限。此外,从有限材料开始的测序过程,往 往存在由于固定和包埋条件以及长期储存而产生的人为突变。这之中的一个特殊问题是,胞嘧啶碱基脱氨变成脱氧尿嘧啶,从而导致在测序反应中出现C-T转变。 此现象的确切机制尚未可知,可能的解释是胞嘧啶的脱氨作用导致在该位置产生了尿嘧啶,后者会与腺嘌呤配对。在测序过程中,这一改变随后会按照C>T 转换后的结果读取。如果在文库构建过程中链信息未能保留,则两条链都会被测序,这时此人为突变可能显示为C>T或G>A转换。很有必要去除这 些人为突变,特别是对于癌症样本的测序分析而言,因为这些干扰在此类样本中会被检测为假阳性。当进行FFPE样本测序时,由于起始原料有限而假阳性基因突 变的相对频率增加,避免人为突变至关重要。

GeneRead DNA FFPE Kit提供了一种从少量FFPE组织切片高效纯化高产率DNA的高效流程。此外,该流程包含去除脱氨基胞嘧啶的步骤,可避免DNA测序出现假阳性结果。
操作流程
在结合QIAamp MinElute柱之前进行脱蜡并对DNA样品的甲醛解交联。加热除去交联后,DNA就可以通过尿嘧啶DNA糖苷酶特异地去除脱氨基胞嘧啶残基。优化的反 应混合物提供了适宜的反应条件,使UNG能从FFPE样品的DNA中特异性去除人为导致的尿嘧啶。DNA结合到离心柱之后,经由Buffer AW1、Buffer AW2和乙醇洗去残留的杂质(比如盐)。残留的乙醇可能干扰随后的酶促反应,需另外由离心步骤彻底去除。DNA洗脱后可直接用于二代测序,也可在–20℃ 下储存。

GeneRead FFPE DNA kit也可在QIAcube全自动核酸纯化仪上自动运行。
应用
GeneRead DNA FFPE Kit可有效减少胞嘧啶脱氨人为突变,从FFPE样品中纯化出可直接供二代测序使用的DNA。

QQ交谈
QQ交谈